Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh16f2Q8K3M1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rdh16f2Q8K3M1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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