Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HscbQ8K3A0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HscbQ8K3A0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms