Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms