Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms