Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccm2Q8K2Y9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms