Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Brd3Q8K2F0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brd3Q8K2F0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms