Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fcho1Q8K285 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fcho1Q8K285 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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