Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1eQ8K202 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1eQ8K202 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms