Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms