Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Glis1Q8K1M4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Glis1Q8K1M4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms