Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700001C19RikQ8K168 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms