Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot3Q8K0V4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot3Q8K0V4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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