Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh2d5Q8JZW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms