Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip10Q8CJ53 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms