Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd3Q8CIK8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd3Q8CIK8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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