Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ercc8Q8CFD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ercc8Q8CFD5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ercc8Q8CFD5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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