Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl11Q8CE33 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl11Q8CE33 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms