Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc178Q8CDV0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms