Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc9Q8CDN9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms