Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc87Q8CDL9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms