Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lancl3Q8CD19 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl3Q8CD19 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms