Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms