Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8C708 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8C708 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8C708 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8C708 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms