Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp20Q8C6M1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp20Q8C6M1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms