Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp1Q8C4U3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms