Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc21aQ8C0S4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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