Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FarsaQ8C0C7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FarsaQ8C0C7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms