Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms