Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnrQ8BYI9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnrQ8BYI9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms