Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc169Q8BXX9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc169Q8BXX9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms