Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec22cQ8BXT9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms