Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem87aQ8BXN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem87aQ8BXN9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms