Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn17Q8BXA6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn17Q8BXA6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms