Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube3dQ8BX13 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ube3dQ8BX13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ube3dQ8BX13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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