Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod1Q8BVA4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms