Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp398Q8BV16 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp398Q8BV16 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms