Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT35

Smim37, Small integral membrane protein 37, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim37Q8BT35 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim37Q8BT35 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms