Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LsampQ8BLK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LsampQ8BLK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms