Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp54Q8BL06 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms