Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms