Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy1Q8BIJ7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms