Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Slc5a7Q8BGY9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Slc5a7Q8BGY9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Slc5a7Q8BGY9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Slc5a7Q8BGY9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc5a7Q8BGY9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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