Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg4bQ8BGE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg4bQ8BGE6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg4bQ8BGE6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atg4bQ8BGE6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg4bQ8BGE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms