Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc172Q810N9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc172Q810N9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms