Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Amigo1Q80ZD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Amigo1Q80ZD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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