Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnnQ80Z71 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnnQ80Z71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms