Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Negr1Q80Z24 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Negr1Q80Z24 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Negr1Q80Z24 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Negr1Q80Z24 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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