Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Lrfn4Q80XU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrfn4Q80XU8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lrfn4Q80XU8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lrfn4Q80XU8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lrfn4Q80XU8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrfn4Q80XU8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lrfn4Q80XU8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lrfn4Q80XU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms