Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Pcsk9Q80W65 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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