Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SnupnQ80W37 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms